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　　化學合成的多肽抗原是小分子，本身很難具有好的抗原性，只能誘導動物產生很弱的免疫反應，因而與載體蛋白交聯是很重要的。載體蛋白含有很多抗原決定基，能夠刺激T－幫助細胞，進而誘導 B－細胞反應。用于與多肽偶聯的載體蛋白有多種，其中最常用的是keyhole limpet hemacyanin (KLH), 牛血清白蛋白（bovine serum albumin，BSA）, 卵清蛋白（ovalbumin，OVA）和牛甲狀腺球蛋白（bovine thyroglobulin，THY)。KLH具有更高的抗原性，是最為常用的多肽偶聯載體。BSA也常用來作為多肽載體，但由于BSA經常被用做檢測試驗的阻斷劑而使得該方法生產的抗體在應用上存在著一定的局限性。

　　動物選擇:
　　要生成好的抗體，必須選擇與抗原源差異較大的動物。要想獲得最大的免疫反應，絕對不能讓免疫動物對抗原產生‘自體識別’。例如，要想生成抗人體蛋白的抗體，使用兔或老鼠比使用猴子要好。對于非常保守的哺乳動物蛋白，使用鳥類動物（如雞）效果較好。

　　動物免疫:
　　我們通常使用弗氏佐劑（Freunds）與抗原進行混合。第一次注射完全使用Freunds的免疫輔助劑。輔助劑與抗原聯合使用，可以提高免疫反應，從而用較少的疫苗可以產生較強的免疫反應。佐劑可以使抗原緩慢釋放，從而產生持續性刺激。注射方式為多位點的皮下注射。每只注射動物都要先收集免疫前血樣，以用于和以后的免疫血樣比較。所采集的血清樣本含有不同的免疫型和亞型。

　　抗體鑒定:
　　檢測抗多肽反應是否發生的最簡單方法就是抗多肽ELISA。有兩種技術可以將多肽鏈接到ELISA板上。第一種方法就是直接將多肽鏈接到盤上。但如果鏈接氨基酸恰好是抗原決定簇的一部分，則抗體無法和多肽進一步鏈接，這樣產生假陰性結果的可能性增加。第二種方法則是先將多肽與載體蛋白偶合，然后將多肽－蛋白偶合體鏈接到ELISA盤上。這種鏈接方法會使抗體－多肽的結合成功率提高，因為多肽不是直接嵌入盤膜，因而會更加暴露給抗體。這種方法因而更可靠，可重復性更高。需要注意的是，用于該方法的載體蛋白必須不同于用于免疫偶合的載體蛋白。這樣會避免血清中抗載體蛋白反應所導致的高背景反應。